云南中医药大学有外语系、基础医学院、中药学医院、护理学院、人文与管理学院、信息研究所、马克思主义学院、体育部、第一临床医学院、第二临床医学院等学院，以下为具体榜单，以供参考，可调整的，以学校最新公布为准。
一、学院设置
| 序号 | 教学机构 |
| 1 | 外语部 |
| 2 | 基础医学院 |
| 3 | 中药学院 |
| 4 | 护理学院 |
| 5 | 人文与管理学院 |
| 6 | 民族医药学院、民族医药博物馆（合署） |
| 7 | 信息学院 |
| 8 | 马克思主义学院 |
| 9 | 体育部 |
| 10 | 继续教育学院、职业技术学院（合署） |
| 11 | 第一临床医学院 |
| 12 | 第二临床医学院 |
| 13 | 国际合作交流处、港澳台办、国际教育学院（合署） |
二、云南中医药大学简介
云南中医药大学（云南中医药大学），称为云，位于云南省昆明市，是云南省人民政府与国家中医药管理局共建高校，国家第二批创办的中医药高等本科院校，云南省唯一一所中医药本科院校，入选国家中医药临床研究基地、全国教育信息化试点单位、云南省中医药国际教育基地。
云南中医药大学前身云南成立于1960年中医学医院，1986年获硕士学位授予权，2016年成为云南省人民政府与国家中医药管理局共建高校，2018年更名云南中医药大学
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